現在絕大多數細胞培養使用的試劑瓶子，都是塑料制品，經不起灼燒，短暫的過火達不到高溫，肯定沒有局部消毒的效果，更別說滅菌了；

超凈臺內的氣流本來就應該是無菌的，酒精燈的熱氣流會干擾通風的流動，反而影響超凈臺本身的層流除菌除塵效果；

所謂酒精燈周圍是無菌區，是在沒有超凈臺的時候，灼燒能產生上升氣流，防止灰塵落入瓶口，但有超凈臺的時候就沒有必要；

在正常情況下，快速操作比在酒精燈附近無菌區磨蹭效果更佳；

使用酒精燈增加了火災的隱患；

無菌是分等級的，超凈工作臺一般可以達到局部百級，不是完全無菌無塵，且紫外線臺內不能100%的消滅微生物。而酒精燈周圍10cm處可以形成一個天然無菌區，是對局部無菌環境的更進一步保障。

酒精燈有上升氣流，可以使其附近大約10cm處的范圍內，沒有灰塵落下，開啟的瓶蓋放置在此區域，就算是暴露狀態下，也不用太擔心灰塵掉落的問題。

培養的試劑，有時不是一次就用完的，需要放置在非無菌環境的冰箱里保存，這過程難免會導致瓶身、瓶口附近附著細菌、灰塵。盡管帶入超凈臺內都會用酒精噴灑，但酒精仍然無法完全滅菌和除塵。其實細菌自己是不會跑的（跑得太慢了），所以細菌的移動不是隨著氣流，就隨著液流，我們適當灼燒瓶口等有液流的地方，使其干燥，就產生了相當于“局部固定”細菌或灰塵的作用，就減少了它們隨液流擴散的可能性。

很多單位超凈工作臺，并沒有定期檢查維護（達不到國外發達國家的條件），最多也就是定期更換濾網，但是否更換濾網之前，其除菌除塵效果已經早就不達標了也不得知，此時在關鍵操作環節置于酒精燈附近操作，是更有保障的。

超凈臺內的酒精燈是不會影響超凈臺的層流除菌除塵效果的，酒精燈局部的氣流范圍本身是無菌無塵的，那些看不見的被酒精燈“趕跑”的細菌灰塵，會進入附近超凈臺提供的層流里，被排出工作臺外。

關于安全問題，酒精燈雖然是明火，正確使用下已經算是很安全的了。不要在酒精瓶身、手套沾有未干的酒精情況下去點燈；不要使酒精燈瓶內的酒精過多或過少；不要使酒精燈傾倒；不要加熱易燃易爆炸物品。