每個實驗室都應設置嚴密的廢棄物清單，固體的、液體的與氣體的，包括未能用盡的試劑及其包裝、實驗過程的副產品與泄漏物、實驗結束后的清理物，根據化學藥品和樣品廢棄物的理化特性，進行分類例如毒性、放射性、腐蝕性、酸堿性、易燃性、爆炸性、氧化性、還原性、污染性。
對每一類廢棄物應標明來源、主要組成、化合物性質，提示可能產生的有毒氣體、發熱、噴濺及爆炸等危險。為防止二次污染，以盡量選用無害或易于處理的藥品或方法為原則，標明具體處理措施，如用漂白粉處理含氰廢水，用生石灰處理某些酸液，用廢酸液“以廢治廢”處理廢堿液。無法妥善處理，必須標明合法的專業處理機構名稱。
進行室內暫存時，應根據性質分類放入室內實驗室廢棄物暫存柜中存放，柜體表面應貼有醒目的警示標示，提醒周圍人群注意廢液分類安全。
處理實驗室廢棄物時，應建立嚴格的處置臺賬，對處理人、處理數量、處理方式、處理時間等相關信息進行詳細記錄，雙人審核，定期檢查，長期存檔。

實驗室廢棄物應依不同性質進行分類收集，不具相容性的實驗廢棄物應分別收集儲存，應由檢測人員按分類規定進行分類收集，分別倒于實驗室指定的儲存容器內收集。對易燃、易爆、劇毒等化學物品在使用中及使用后的廢渣、廢液，實驗操作人員應及時妥善處理、分類倒入指定的容器內，嚴禁亂放亂丟。對實驗使用后的培養基、標本和菌種保存液，一次性的醫療用品及一次性的器械，都應嚴格按規定進行有效消毒并放置指定的容器內。

廢棄物的正確包裝關鍵是選對容器，貼準標簽。廢棄物應裝在設計及構造適當的密閉容器內，分別是不銹鋼桶、塑料桶和玻璃瓶。容器及封蓋上任何直接與廢棄物接觸的部分，不能與廢棄物發生反應而產生危險產品或減弱容器的堅固性。必要時，容器及封蓋應加內襯墊、涂層或予以其他處理，容器或襯墊的材質應充分考慮其化學穩定性。
所有廢棄物的裝載容器都應密封完好，表面清潔，標識清晰易讀，標簽貼附牢固，舊標簽全部去除。標簽的樣式和尺寸應參照規范。標簽材質以防腐、耐磨為佳。規范的標簽在為實驗室提供安全警示的同時，也科學的裝飾了實驗室。
   容器標簽上應標明廢棄物名稱、類別、危險情況、安全措施、實驗室廢棄物產生單位、地址、電話及日期等信息。當含有多種化學品時，一般只須列出主要廢棄物成分。

為確保廢棄物能夠抵御自然外力及人為因素的破壞，應高度重視貯存場所建設，貯存設施、設計、運行、安全防護和監測等均應符合標準，并在明顯處設置警示牌，應有專人負責，定期檢查并記錄，定期聯系相關專業單位，對廢棄物進行專業化處理。廢棄物的貯：
1.遠離熱源，對高溫易爆或易腐敗的特殊廢棄物還應在低溫下貯存。
2.要分類貯存，不相容的廢棄物不得混合貯存，且廢棄物容器上應加貼標簽，對混合后有可能產生危險后果的不同類別，對不同來源的廢棄物，切勿貪省事而裝載在同一容器內。
3.要防止膨脹，確保容器內的液體廢棄物在正常的處理、存放及運輸時，不因溫度或其他物理狀況轉變而膨脹，造成容器泄漏或永久變形。
4.要通風良好，不得有散遺、滲出、污染地面或散發惡臭等情形。制訂嚴格的操作規范，要求實驗室人員必須按規范處理廢棄物，如配備專用的防濺眼罩、手套和工作服，在特殊情況下于通風柜外處理廢棄物時，操作人員必須帶上具有過濾功能的防毒面具。制訂嚴格的應急程序，在醒目處張貼，定期組織應急演練，備置足夠、合格的應急器材，以應對在處理、收集及存放實驗室廢棄物時發生的溢出、泄露、火災等緊急情況。