種子在貯存期間仍不停地進行呼吸，陸續釋放出水分和熱量。如果這些水分和熱量不能及時散發，而聚集在種子堆里，就會加劇種子的呼吸強度，而釋放出更多的水分和熱量，如此反復，互相促進，時間長了就會引起種子發熱。
　　
　　由于種子的呼吸作用，使種子堆內積聚了大量的水分和熱量，這有利于微生物的生長繁殖。而在微生物活動中，能釋放出更多的水分和熱量，更易引起種子發熱。
　　
　　種子在貯存過程中，由于貯存條件不善或管理不當，會出現種子吸濕返潮現象，種子含水量越大，呼吸就越強，釋放出的水分和熱量也就越多，而造成種子發熱。
　　
　　另外，有些害蟲如谷蠹之類，如果大量繁殖活動，也能促使種子發熱。
　　
　　防治措施
　　
　　種子倉庫應選擇建在地勢高燥，地下水位低，向陽背風的地方，倉庫要具備一定的防潮和隔熱性能，既能密閉保持低溫干燥，又能通風，防溫散濕。
　　
　　種子含水量越低，呼吸越弱。在種子貯存前，應充分晾曬、揚凈并嚴格檢驗，使其含水量、凈度等，達到安全貯存標準后，才能入庫貯存。如因天氣不好等原因，沒有充分晾曬，在種子入庫后，應進行強烈通風，使種子含水量下降。
　　
　　種子后熟期間，呼吸旺盛。因此，在種子入庫貯存前，應充分晾曬，以促使其后熟作用提前完成；對后熟作用時間較長的作物種子，入庫貯存初期，應進行強烈通風，以降溫散濕。
　　
　　種子暴曬后應充分攤晾降溫，再入庫貯存，以免造成種子溫度過高，增強呼吸，或因倉庫與種子溫差大，而出現水分再分配現象，造成種子吸濕返潮。
　　
　　在種子貯存期間，應加強對倉庫溫濕度的檢查。如有異常現象，應選擇晴朗天氣，及時通風換氣，降溫散濕，并查明原因，及時采取應對措施。
　　
　　在種子貯存期間，還應加強對種子溫度、含水量和害蟲的檢查。有異常現象，應及時采取應對措施，如通風換氣、深耙種子堆表面、翻倉倒囤、晾曬除雜等，以散潮降溫。采用暴曬、冷凍等方法，惡化害蟲和微生物的生存條件，也能直接殺死害蟲和微生物。如蟲害較嚴重或不易翻倉倒囤進行晾曬，可用磷化鋁或磷化氫等藥劑防治。