1.地面堆碼貯藏。選用沒有直射光、空氣流通,土質或紅磚地面的空屋作貯藏室。地面墊5cm厚稻草或麥秸,將老熟、無損傷南瓜堆上。堆放時,保持南瓜挨著地面的方向向下,瓜蒂朝里瓜頂向外碼成圓錐形。每堆15~20個,大型瓜不要堆得太多,防止擠壓,并有利于通風。初期夜間開窗通風換氣,白天關閉遮陽,保持室內空氣新鮮、干燥和涼爽;冬季關閉門窗防寒。
2.架式分層貯藏。貯藏室內用竹木或角鐵搭成分層貯藏架,每層高度比南瓜高8~10cm。每層貯藏架上鋪5cm厚稻草或麥秸。南瓜擺放狀態與堆藏相同,架式分層貯藏效果優于地面貯藏。
3.地窖低溫貯藏。地上鋪墊5cm厚的細沙或麥秸、稻草,堆放2~3層瓜;也可搭架子將南瓜放在架子上。窖內溫度控制在10℃左右,相對濕度保持70%~80%。貯藏前要注意選好南瓜,適期采收,不能遭受霜打,瓜蒂處保留5cm長的瓜梗,防止機械損傷。貯藏中要注意勤檢查,發現有病斑的瓜立即剔出以免感染好瓜。