近期因根腐病、細菌性髓壞死和灰霉病危害引起番茄死棵的現象較普遍，應注意防治。

番茄感染根腐病后，植株先出現萎蔫癥狀，中午時表現嚴重，早上和傍晚可恢復，拔出病株可見根部表皮變褐腐爛，易剝落，不及時防治會導致死棵。發病后，可以在每15公斤水中加入普力克722克/升霜霉威鹽酸水劑10毫升、金雷68%精甲霜·錳鋅水分散粒劑35克和福星40%氟硅唑乳油2毫升灌根防治。針對病株，還可以將已經摘除果實的番茄莖稈撲倒覆土，促進莖稈產生不定根，保證植株上部的營養供應，減輕根腐病造成的危害，促進植株生長。另外，在定植前通過穴施“激抗菌968壯苗棵不死”等生物菌肥，利用有益生物菌抑制有害病菌的生長和繁殖，可以減少根腐病發生。

番茄出現細菌性髓壞死時，植株下部葉片會萎蔫，此時可在發病部位看到有許多不定根產生，將莖稈劈開可見莖內部變褐色，并逐漸沿莖稈向上向下發展，嚴重時莖稈內部出現空腔，最終導致植株死亡。防治該病時，可選用具有內吸性的抗生素，如用3%中生菌素可濕性粉劑1000倍液或40%農用硫酸鏈霉素可溶性粉劑2000倍液灌根防治。對發病嚴重的植株，可用DT30%琥膠肥酸銅可濕性粉劑500倍液對發病部位上部注射防治。

灰霉病之所以能導致番茄死棵，是因為沒有及時將病葉、老葉、殘花等摘除，灰霉病病菌易侵染這些敗葉，這些帶菌敗葉掉在植株莖稈上后會導致莖稈爛掉出現死棵。應及時將植株上的病部、黃葉、殘花等疏除，防治其落在莖稈上，從而有效避免感染的植株，可以用水將菌核凈稀釋成糊狀后涂抹病部，在涂抹前先用刀將病部霉層刮凈，然后涂抹藥物，以保證防治效果。