隨著抗蟲棉的全面種植，棉蚜、棉葉螨、枯黃萎病、棉盲蝽成為棉田主要病蟲害，嚴重影響了棉花產量和品質的提高。 
一、棉苗病棉花苗期病蟲害主要以立枯、猝倒病為主，苗期低溫、多雨、重茬、播種過早等因素是棉苗病多發的重要原因。棉苗根病初發時，及時用40%多菌靈膠懸劑+新高脂膜800倍液、65%代森鋅可濕性粉劑+新高脂膜800倍液或36%棉枯凈可濕粉劑10-15克/畝，兌水15公斤順棉苗莖稈噴霧，間隔5-7天，再噴一次。

二、棉蚜 苗蚜發生在出苗到現蕾以后，當卷葉率達30%以上時開始防治，6月中旬-7月下旬是棉蚜為害盛期,可選用10%吡蟲啉可濕性粉劑+新高脂膜800倍液或15%金好年乳油+新高脂膜800倍液進行莖葉均勻噴霧。蕾鈴期伏蚜發生時，由于溫度高，可選用3%啶蟲脒乳油2000倍液加40%毒死蜱1200倍液+新高脂膜800倍液防治蚜蟲兼治其它害蟲。棉株封行后，還可用80%敵敵畏乳油+新高脂膜800倍液，晴天無風的傍晚噴灑于棉壟間，對伏蚜效果較好，并可兼治棉花紅蜘蛛。

三、棉葉螨5月上旬開始在棉花田點片出現，此時氣溫較低,繁殖速度慢,單葉螨量較少,棉苗受害較輕。6月初-7月下旬，氣溫很快上升,棉葉螨開始大量繁殖，集中危害,干旱年份為害猖獗。可選用15%掃蟲螨凈乳油+新高脂膜800倍液、或1.8%阿菌素+新高脂膜800倍液進行噴霧防治。

四、棉盲蝽：棉盲蝽對棉花的為害逐年加重，化學防治時期在6月中下旬，此期棉花植株比較幼嫩，如遇多雨，棉田相對濕度大的氣候條件，有利于棉盲蝽的危害，該時期是防治關鍵期。在棉花蕾期、鈴期，可選用5%啶蟲咪乳油+新高脂膜800倍液或4.5%高效氯氰菊酯乳油+新高脂膜800倍液噴霧防治，效果較好,同時兼治棉鈴蟲。

五、棉鈴蟲是棉花蕾鈴期的主要害蟲，一年一般發生4代。主要以第二、三代為害棉花，以幼蟲蛀食蕾、花、鈴造成為害為主，被蛀棉鈴易爛脫落或成為僵瓣。可采取綜合防治的方法。1.物理防治：在棉花集中種植區安裝佳多頻振式殺蟲燈，每60畝配備一套，連片使用效果更佳。2.化學防治：可選用90%萬靈可濕性粉劑+新高脂膜800倍液，4.5%高效氯氰菊酯乳油+新高脂膜800倍液或1.8%阿維茵素+新高脂膜800倍液進行莖葉噴霧，間隔7天噴一次，連噴2-3次，后期掃殘時可用20%辛滅乳油+新高脂膜800倍液或20%氰馬乳油1500倍液均勻噴霧。

六、棉花枯、黃萎病都是為害棉花的維管束組織的病害，引起棉花葉片變色、干枯、脫落萎蔫等癥狀，嚴重時連片枯死，影響產量。可在棉花蕾期用枯黃萎靈每畝40克兌水噴霧（最好是連噴帶灌）3-4次。

七、甜菜夜蛾屬雜食性害蟲，一年發生4-5代，世代重疊嚴重，蟲齡不整齊，高溫干旱氣候因素和多種作物混種的栽培條件有利于甜菜夜蛾的發生，一般管理粗放，雜草多的棉田發生較重。可選0.2%甲維鹽+新高脂膜800倍液或25%滅幼脲懸浮劑+新高脂膜800倍液,均勻噴于棉株和田間雜草上，連噴2-3次，效果較好。