隨著氣溫下降，溫室大棚中濕度逐漸加大，黃瓜褐斑病、蔓枯病等病害易發生，要注意防治。

褐斑病發生時，黃瓜葉片上分布有褪綠淺褐色病斑，澆水后遇陰天易發病。蔓枯病最明顯的癥狀就是葉片上有自葉緣向內呈“V”字形的病斑，瓜條上出現乳白色的膠狀物，棚內濕度大時易發病。這兩種病害發生后，可以選用甲基硫菌靈加百菌清，或多菌靈加福美雙，或噻霉酮加溴菌·多菌靈防治，每隔7天一次，連續防治2-3次。

細菌性葉枯病發生時，葉片上出現很小的水漬狀褐色斑，并有穿孔。細菌性圓斑病發生時，葉片上出現較小的圓形黃色病斑，膜質半透明。這兩種病害可以選用30%王銅懸浮劑或20%葉枯唑可濕性粉劑500倍液噴霧防治。唑類藥劑會抑制作物頂部生長，噴藥時不要噴到植株頂部生長點。

擬莖點霉根腐病，又稱嫁接黃瓜根腐病，黃瓜嫁接成活后暫不發病，一般有8-10張葉片后，作為砧木的黑籽南瓜主根與側根出現褐變腐爛，引起植株萎焉枯死。發病后及時用多菌靈加代森銨和生根劑灌根治療。