有人歸納了外刊論文撰寫的五個基本要求，即5C：正確（correctness）、清楚（clarity）、簡潔（concision）、完整（completion）和一致性（consistency） 。只有在滿足這5點要求的情況下才可以算是一篇合格的外刊文章。對此，我深表同意。下面，從外刊論文的基本結構分別來說明我的看法：
1）Introduction
我一直認為Introduction是外刊文章最為難寫的部分之一（另外一個是Discussion）。中文文章的缺陷就在于Introduction沒有內涵，過于簡單，沒有真正體現出一篇論文的研究起初和創新要素。應該說外刊論文對于Introduction的要求是非常高的，可以毫不夸張的說，一個好的Introduction就相當于文章成功了一半。所以大家應該在Introduction上集中足夠的精力。
我認為要寫好一個Introduction，最重要的是要保持鮮明的層次感和極強的邏輯性，這兩點是結合在一起的，即在符合邏輯性的基礎上建立層層遞進的關系。
一開始，我們要首先闡述自己研究領域的基本內容，要盡量的簡潔明了，不要羅里羅嗦一大堆。須知看文章的人都是該領域的專家，所以一些顯而易見的知識要用概括性的而不是敘述性的語言來描述。
接下來，就是Introduction的重頭戲之一：文獻的總結回顧。這一點要特別著重筆墨來描寫。一方面要把該領域內的過去和現在的狀況全面的概括總結出來，不能有絲毫的遺漏，特別是最新的進展和過去經典文獻的引用。這是兩個最容易出現的問題，應該是我們要極力避免的。如果一旦審稿人之處這兩個毛病，很可能意味著說你做的不夠深入或者全面，負面作用是非常明顯的。另一方面，文獻的應用和數據的提供一定要準確。片面的摘錄部分結果而不反映文獻的總體結果是千萬要不得的。引用的數據也要正確，特別是間接引用的數據（即不是從原文獻中查到的數據，而是從別人的文獻中發現的另外一篇文獻的數據）。數據出錯會導致文章的印象大大失分。此外，引用文獻的時候注意防止造成抄襲的印象，即不要原文抄錄，要用自己的話來進行總結描述。如果審稿人正好是文獻的引用者的話，這樣做就會糟糕的。
然后就是分析過去研究的局限性并且闡明自己研究的創新點，這是整個Introduction的高潮所在，所以更是要慎之又慎。闡述局限性的時候，需要注意的問題是要客觀公正評價別人的工作，不要把抬高自己研究的價值建立在貶低別人的工作之上，這往往是我們寫中文文章中容易犯的毛病。在外刊論文的寫作中，這是萬萬要不得的，一定要遵循實事求是的原則來分析。在闡述自己的創新點時，要僅僅圍繞過去研究的缺陷性來描述，完整而清晰的描述自己的解決思路。需要注意的是文章的攤子不要鋪的太大，要抓住一點進行深入的闡述。只要能夠很好的解決一個問題，就是一篇很好的文章了。創新性描述的越多越大，越容易被審稿人抓住把柄。中文文章的特點是創新性要多要大，而英文文章的特點恰恰相反：深入系統的解決一到兩個問題就算相當不錯。
最后，就是總結性的描述論文的研究內容，可以分為一二三四等幾個方面來描述，為Introduction鱟詈蟮氖瘴補ぷ鰲?
至此，Introduction的寫作算是大功告成。但是寫完之后，還是要慎之又慎的仔細修改，仔細的琢磨里面的每一個句子是否表達的恰當準確，這對Introduction的修改完善是至關重要的。
2）Methods
Methods部分是描述我們論文的實驗過程（這是針對理工科而言，文科我不知道不能妄言）。這一過程的寫作相對來說較為簡單，但是需要注意的問題卻不少，重要的在于完整和科學。完整就是實驗當中的每一個環節都要注意到，不要顧此失彼，遺漏一些重要的內容。
Methods部分一般可以按照實驗對象、實驗設備、實驗材料、實驗記錄、實驗分析方法等幾個方面來進行組織。實驗對象一般是人或者動物或者是一些組織等等，它們的基本信息要描述明確。此外需要注意的是國外的刊物大多對牽扯到人或者動物的實驗都有一些特定的要求，有些是不允許在人或者動物身上進行的實驗操作的，這需要認真閱讀投稿刊物中關于實驗的詳細規定。如果違反這一規定的話，可能會不接受評審或者發表，這一點要特別注意。
實驗設備的描述中，要對儀器的型號、生產廠家、實驗過程中的用途等做詳細的說明（牽扯到保密項目的可能有另外的寫法，我不清楚）。對實驗設備之間的鏈接要做到科學正確，不要給人混亂或者操作錯誤的感覺。設備使用的時候一些必要的步驟不可或缺，尤其是有可能對實驗結果造成特定影響的操作更是要詳細說明。這樣做的好處，是為了在Discussion中能夠進行對應的分析。比如，一些設備在使用之前要首先進行校正（calibration），有的要求每個階段實驗之后都要重新校正，以保證結果的正確性。這一點一定要詳細說明你的操作步驟或者校正過程，便于評審人分析你的結果。
實驗材料的描述根據不同的學科應該有不同的要求，這里很難加以詳細的描述。總體上來說要注意說明材料選擇的必要性，也就是對為什么選擇這種材料最好有一定的說明。如果這一點上描述不清的話，可能會導致整個實驗過程是不成立的。
實驗過程就是講自己實驗的整個操作流程描述清楚，一般都要附加以實驗的流程圖進行說明。流程圖的畫法很多，有的是文字式的，有的式文字和示意圖結合的，根據不同的實驗有不同的做法。一般來說，可能后者多一些（對一些實驗性學科來說尤其如此），因為這樣做能夠使評審人對你的實驗過程一目了然。如果示意圖花的漂亮的話，還可以增強一些印象分。描述的時候，要有鮮明的層次感，對每個步驟之間的順序和關聯要描述清楚，不要造成實驗過程混亂不堪的印象。因為最終評審人判斷你的實驗是否合理，是從這個過程的描述來的。
只要能在上述4個方面做到完整和科學的描述，相信寫好Methods不是問題。
3）Results
不少人在寫論文的時候會把Results和Discussion兩部分放在一起寫，但是大多數的論文都是分成兩個部分。這兩種做法的選擇，取決于文章的類型。如果你的結果在分析的同時進行討論更加合適，并不適合單獨拿出來分析（或者是那樣做很困難，導致Discussion成為雞肋的時候），那么合在一起寫是合適的；反之就要放在一起寫。因為我沒有放在一起寫的經驗，所以這里就只好單獨分開來說了。希望有合在一起寫經驗的人能夠補充這方面的內容。
Results部分的要求是四個字：翔實準確。翔實就是要提供最為全面的分析結果，一切從你的實驗當中能夠得到的結果都應該提供給讀者，不要故意的隱瞞或者遺漏某些重要的結果。準確就是結果必須是要真實的，不能是偽造合篡改的。從某種意義上來說，結果不夠翔實并不會導致論文直接被拒，但是結果的真實性被人懷疑的話就肯定會被拒。
在結果的提供上，一般是表格和圖兩種方式。不同的雜志對于圖表的要求并不完全一致，應該要根據雜志的要求分別對待。表格的優點是能夠清晰的展示論文獲得的第一手結果，便于后人在研究時進行引用和對比。圖的優點在于能夠講數據的變化趨勢靈活的表現出來，表達上更為直接和富于感染力。應該來說，圖表應該結合起來使用，這樣能各自取長補短，使得結果的展現更加豐富。應該要提出的一點是：現在大家越來越喜歡給各種各樣的圖，但是雜志社的要求卻是要盡量限制圖的個數。因為這樣子會增加排版的困難，版面也會增加，出版社的支出也就會增加。因此，我的建議是大家在提供圖的時候，盡量用最少的圖提供最多的信息，一般來說最多不要超過8個。圖太多了，會顯得過于羅索和累贅，主編那里就不會很欣賞。必要的時候可以用表格來替代一些圖。圖片的格式每個雜志不太一樣，要求tif格式的比較多，不推薦使用bmp（jpg就更不能用）。有人說用矢量圖清楚些，我的感覺和tif格式的沒什么區別，只要足夠清晰也就可以了。彩色圖片的使用要慎重，因為黑白圖片可以免費，但是彩色圖片是絕對要收費，而且價格不菲。
在Results和Discussion分開寫的情況下，Results部分盡量不要設計對結果的評論，最多是總結的陳述結果也就可以了。否則造成這兩部分的內容上的重疊，會顯得很累贅，對Discussion的描述不利。結果的描述上也要注意層次之間的安排，要按照條理性的要求分別描述，顯得有邏輯性一些。不要亂七八糟的堆在一起，只是給出來了就可以了。結果給的一團糟，會大大降低論文的可讀性，吃虧的最終是自己。
Results中大多都要提供統計性的結果，例如方差分析等。方差分析的結果形式要根據刊物的格式來給出，有的要求對分析值、自由度和概率都要詳細的給出，有的則只要分析值和概率就可以了。概率可以用p=0.02或者p<0.03等形勢給出，自由度的表達也有一些特殊要求。這些細節問題雖然關系不大，但是注意格式要統一，不要亂七八糟各自為戰。統計分析結果過多時，可以用表格的方式來給出，具體上可以參照SPSS軟件分析之后的結果。如果論文結果部分通篇都是統計分析的數據，會顯得凌亂不堪，表格的形式會避免這種情況的發生。
4）Discussion
前面已經說過，Introduction和Discussion是整篇論文當中最為難寫的兩個部分。Discussion部分之所以難寫，是因為這里面最能夠顯示一個作者研究問題的深度和廣度。深度就是論文對于提出問題的研究到了一個什么樣的程度，廣度就是是否能夠從多個較多來分析解釋實驗中的結果。要寫好Discussion，我想大概可以分為下面兩個步驟：
第一，選擇要深入討論分析的問題。Results部分中，有的結果是重要的，有的則是一筆帶過的。選擇合適的結果在Discussion部分中進行深入的討論，是寫好該部分首先面臨的一個問題。一般來說，可以根據一個簡單的原則來判斷：如果你得到的結果體現了實驗的獨特性，是其他研究中沒有得到的結果，那么這個結果就是應該要重點討論的問題。有些結果是和前人的研究相一致的，并沒有顯著性的差異，那么就應該一筆帶過不要深入討論，否則那只是重復別人的工作而已，沒有任何價值。Discussion的一個重要作用就是要突出自己研究的創新性，體現出顯著區別于他人的特點，區別大和小是另外一個問題，重要的在于有區別。
第二，對選中的問題按照一定的層次從多個角度來進行討論。選擇的問題有時候不只一個（實際上多數情況下是2個以上），所以描述的時候就要按照一定的層次描述清楚。一般來說要把最重要的放在中間，次之的放在開頭和末尾。我覺得放在中間能夠將評審人的情緒帶至最高潮，前面是一個鋪墊，后面是一個總結。這樣的順序似乎更合適一些，不妥之處還請諸位大家指正。無論問題大小，重要與否，都要從多個較多展開深入的討論。這方面首先要有類似結果的對比，說明自己結論的獨特性。其次，就要系統的闡述為什么會有這樣的結果，方法可以有多種：從實驗設計的角度，從理論原理的角度，從分析方法的角度，或者借鑒別人分析的方法等等。這并沒有所謂一定的規則，重要的在于將這個問題深入的闡述清楚，不能讓人有意猶未盡之感（這樣其實很困難，因為評審人總是會提出新的問題，我們只能盡量做到這一點）。
在Discussion中，需要特別指出的是要保持和Results的一致性，也就是結果和討論要一一對應，前后呼應，相互襯托才可以。千萬不要出現按照討論的內容會推出與實驗相反的結論這種事情，那就證明你的討論思路是徹底的失敗或者你的實驗壓根兒就是失敗的。所以在Discussion的文字描述中，語言表達的精確性尤為重要。由于中英文表達習慣上的不同，總是會出現一些誤解的情況，這一點要盡量在投稿之前解決好，否則由于這個問題導致被拒是很冤枉。
到此為止，外刊論文的四個主題部分都介紹完了。有人說還少了Abstract和Conclusion，不過我認為只要上述四個部分解決好了，這兩個寫起來輕而易舉，并且這兩個部分也不屬于評審人重點關注的問題（Abstract的重要性要略微高點）。下面再介紹一下另外兩個部分：Acknowledge和References。
關于Acknowledge部分，主要的內容分為兩個：第一是表明研究的基金來源，象中國的話一般都是Nature Science Foundation of China （NSFC，國家自然科學基金），美國的話大多是National Institute of Health（NIH，美國國家衛生研究院）。寫上基金的時候一般都要標注清楚基金的號碼（Grant Number），只有這樣才算是該項基金的研究成果，也可以算做實驗室的研究成果。須知沒有任何一項研究成果是在沒有資金資助的情況下完成的，所以這一點非常必要。第二是對參與人員（沒有列在作者中的研究人員）和單位表示感謝，如果通過一審和最終接受發表，還要添加上對editor和anonymous reviewers的感謝，這是一種最基本的禮貌。中國人的文章中很多人會少掉這部分，這一點很不好。
關于References，重要的在于格式。不同的雜志對于參考文獻的格式要求不一樣，具體下來有所區別的可以分為：作者的寫法，有的是簡寫在前，有的簡寫在后，有的簡寫有點，有的簡寫沒有點；文章的名字，有的要加上引號，有的沒有引號；期刊的寫法，有的要簡寫，有的要全稱，有的要斜體，有的則不需要；年和期卷號的順序，有的是年在前，有的是年在后；期刊論文、書、學位論文、會議論文，四種引用的格式各不相同；文獻的排列順序，有的是按照字母的順序，有的則是按照在論文中出現的順序用阿拉伯數字排序。基本上就是這些問題，看來很是瑣碎，但是如果你的參考文獻排列的亂七八糟，那就會使得評審人對你論文的印象很差，認為你沒有認知組織和撰寫論文，造成一定的負面影響。所以，事情雖小，影響卻大，還是要認真組織為好。
此外，論文在撰寫的時候要自始至終都用英語來寫，千萬不要先寫中文再翻譯成英文。這樣寫出來的文章肯定是中不中，英不英，而且還極大的浪費精力。寧可一開始寫得語法差一些，但是慢慢修改都要比這種寫法好。況且如果有同專業英語比較好的人幫助的話，那這樣寫就更加省事了。寫作的時候，行文的時態要注意。中文沒有時態的問題，但是英文有，而且要求還相當嚴格。一般來說，大多數情況下是過去時態，在Introduction文獻的回顧，Methods的整個部分，Results結果的總結，Discussion中的大部分，都要用過去時態來陳述。其他情況下可以用一般時態來描述。時態之間的界限是比較嚴格的，最好是仔細的通讀國外的論文好好分析一下，或者讓有經驗的人幫你把把關，這樣比較好一些。