水稻的施肥量應根據土壤養分供應量、水稻目標產量、肥料利用率及各種肥料的性質等多方面因素確定。
（1）土壤養分供應量
水稻所吸收的養分，一部分來自所施的肥料，一部分由土壤供給。由土壤提供的養分數量，決定于土壤養分全量及有效狀態。這些又因土壤種類、自然條件及施肥和耕作管理水平而不同。
一般講，江河沖擊土壤較鹽漬土土壤肥力高；旱地改水田比老稻田釋肥量大；冷浸田土壤有機質含量高，但養分釋放量小；砂土地地溫高，養分揮發快，但后勁差；洼地土溫低，養分釋放慢但后勁足。土壤養分供給量可按上年產量的50％～70％來估算。
（2）肥料利用率
施到土壤中的肥料，不能當季被水稻全部利用，肥料利用率的大小與肥料種類、施用方法、土壤性質等因素有關。氮肥、鉀肥利用率為30％～50％，過磷酸鈣為20％～40％，糞便為10％～20％，綠肥耕翻利用率為40％～50％。
施用方法與施肥時期不同，肥料利用率也不同。深層施肥比撒施，集中施用比撒施可提高肥料利用率。氮素化肥作基肥比作追肥利用率低。追肥在幼穗發育期施用利用率高。
（3）產量與施肥量
在實際生產上，根據水稻的需肥量、土壤供肥能力及肥料利用率，就可以估算出不同目標產量的施肥量，但實際施肥量常因條件的不同而變化。雖然產量與施肥量有一定的相關關系，一般情況下，產量因施肥的增加而增加，但并不是施肥越多，稻谷產量就越高，應有一定范圍。
適宜的施肥量，因品種、土壤、氣候和栽培方式不同而不同。因情況復雜，一般情況，在中等肥力的稻田畝產量400～500kg稻谷，應施純氮12～15kg，氮、磷、鉀適宜比例為1:1:1.4。